心电图
在没有进行心脏超声检查条件时，心电图可提示某些心脏病的特征性改变，如电轴重度左偏提示心内膜垫缺损;电轴左偏并左心室肥大提示三尖瓣闭锁，或右心室发育不良和肺动脉闭锁等。
胸部X光片
如果怀疑新生儿存在心脏病，可去拍摄胸部X光片。通常，蛋形心脏提示大动脉转位，靴形心脏提示法洛四联症。
超声心动图
包括M型超声、二维超声、彩色多普勒超声，近年发展的三维超声，这是新生儿期心脏病最有价值的诊断方法。对于新生儿来讲，由于显示的图像清晰，可对各种心脏、大血管和冠状动脉畸形均能诊断，并能判断心功能及肺动脉压力。而且。这种检查没有创伤，容易被家长和患儿接受，还可用来动态观察心脏变化。
心脏磁共振显像
这也是一种无创性检查，主要用于超声心动图不能诊断的畸形先心病，如周围肺动脉畸形和内脏异位等。
心导管和心血管造影术
随着超声心动图的发展，心导管的诊断价值退居次位，主要用于超声心动图不能见到的动静脉旁路、远端肺动脉发育不良等。但对于复杂的心脏畸形，在手术前还需进行心导管检查和心血管造影术，进一步明确心脏畸形和各项生理指标。目前，心导管和心血管造影术更多的是用于治疗，如新生儿早期房间隔造瘘术和动脉导管堵闭。
