但是，由于蛋白质分解后，在肠道一些细菌的作用下产生氨，在正常情况下，可被肝细胞通过解毒作用而消除，但慢性肝病、肝硬化患者，由于肝细胞大量坏死或有效细胞明显减少及其他原因，导致这些有毒物质绕过肝细胞，不被解毒，进入体循环，引起大脑功能障碍，使病人出现神志模糊，情志异常，甚至导致死亡。临床上因为吃一个鸡蛋而导致肝昏迷的并不少见。
因此，在肝昏迷期应严格控制蛋白饮食，每日至少供应6688焦尔热量，给予葡萄糖和支链氨基酸制剂。恢复期先给予蛋白20g/d，以后增加到40g，即使完全清醒也不能超过50g/d。
