由于骨质疏松后期所导致的骨骼病理改变尚无法从根本上治愈，因此骨质疏松治疗的关键在于早期，而根据不同的情况选择合适的药物尤为重要。
由于受到广告的误导，不少人以为补钙就是治疗骨质疏松。其实钙剂与维生素D3是骨质疏松防治的基础药物。人体对钙剂的主动吸收是有阈值的，当钙浓度达到饱和阈值时，人体将难以吸收更多的钙。因此补钙的方法十分重要，首先是适量，最好分次进行,临睡前服用更佳。
对于绝经后骨质疏松患者，尤其是绝经早期伴更年期症状者，雌激素补充疗法十分有效。若年龄超过55岁，且没有明显的更年期症状，则建议选用阿仑膦酸钠并补充活性维生素D3。由于补充雌激素有一定的风险，有下列疾病则不能使用雌激素：雌激素依赖性肿瘤(乳腺癌、子宫内膜癌)、血栓性疾病、不明原因阴道出血及活动性肝病和结缔组织病为绝对禁忌证。子宫肌瘤、子宫内膜异位症、有乳腺癌家族史、胆囊疾病和垂体泌乳素瘤者慎用。有子宫者应用雌激素时应配合适当剂量的孕激素制剂，以对抗雌激素对子宫内膜的刺激，已行子宫切除的妇女应只用雌激素，不加孕激素。激素治疗的方案、剂量、制剂选择及治疗期限等应根据患者情况个体化。应用最低有效剂量。坚持定期随访和安全性监测(尤其是乳腺和子宫)。
对于老年性骨质疏松患者，由于活性维生素D3代谢物缺乏及维生素D抵抗伴代偿性甲状旁腺激素分泌增加是老年性骨质疏松的重要病因，故补充活性维生素D3是必须的。如果骨量下降明显并伴有骨痛或骨关节炎的老人,降钙素和二膦酸盐也十分有效。
如果是由于其他疾病引起的继发性骨质疏松，首先应治疗原发病，同时应用活性维生素D3、二膦酸盐或降钙素也很重要。
由于骨性关节炎(俗称骨质增生)是老年人最常见的骨骼系统退行性疾病，骨质疏松同时伴发骨性关节炎者亦十分常见。降钙素和活性维生素D3不仅能治疗骨质疏松，同时对软骨损伤修复有良好的促进作用，而二膦酸盐既可治疗骨质疏松又能抑制过度的骨质增生，因此降钙素、活性维生素D3和二膦酸盐是骨质疏松伴骨性关节炎临床治疗的选择。
不少骨质疏松患者的一个重要表现是腰背部或者髋部酸痛(俗称骨痛)，对于此类患者应选择降钙素，如果对降钙素过敏，则可考虑二膦酸盐治疗。需指出的是无论降钙素还是二膦酸盐都不是止痛剂，疼痛的缓解需要一定的时间。所以治疗早期可期联合应用非类固醇类药物，以确保止痛疗效。
骨质疏松防治的最终目的是避免骨折。绝大多数临床骨质疏松治疗药物对降低骨质疏松性脊柱骨折有一定疗效，但循征医学研究表明二膦酸盐(阿仑膦酸钠、利塞膦酸钠)具有减少骨质疏松性脊柱骨折和髋部骨折的显著疗效。而降钙素和活性维生素D3能改善骨质量,提高其生物力学性能，对降低骨质疏松性骨折发生率也有明显作用。对于已经发生骨质疏松性骨折接受手术治疗的同时进行抗骨质疏松药物治疗。在骨折发生2周后可应用二膦酸盐或活性维生素D3等药物。
总之，对于骨质疏松，不同的征候，应选择合适的药物，恰当的个体化治疗，才能取得预期的疗效。
