乙胺嘧啶为应用较广的防疟疾药物，毒性比较大，用量过大或长期应用都易引起中毒，由于此药微香而味略甜，小儿可能误作糖果进食大量引起中毒，母亲误服大量对吃奶的小儿也可引起中毒。
本药中毒症状经常在服药后30分钟到6小时内出现。轻者有恶心、呕吐、腹痛、腹泻、头痛、烦躁不安，皮肤可出现红斑样皮疹，小便次数增加。中毒严重者有眩晕、双眼视物模糊、青紫、运动不协调、步态不稳、反复抽搐、心跳增快或不整齐，还可出现黄疸、贫血等，可因全身抽搐和呼吸衰竭而引起死亡。部分病儿突然发生惊厥、昏迷、高热、青紫等危重症状。较长时间使用治疗剂量，可出现无力、食欲下降、贫血、白细胞和血小板减少等症状。
