他曾在北京检核检点《四库全书》，得见其中收载了吴又可的《温疫论》，深感其阐述宏阔有力，发古人之所未发，极有创见，又合于原形，便细心研究，受到了很年夜的启发。他对叶天士更是推许，但以为叶氏的理论“多南方证，又立论甚简，但有医案散见于杂证之中，人多忽之而不穷究。”于是他在担任了叶天士理论的基本上参古博今，联络临证经历，撰写了《温病条辨》5卷，对温热病学说做了进一步的阐扬。
他以为温病有9种，吴又可所说的温疫是其中最具熏染性的一种，除此之外，此外另有其他八种温病，可以从季节及疾病默示上加以区分，这是对付温病很完备的一种分类要领。书中创设了“三焦辨证”的学说，这是继叶天士成长了张仲景的六经辨证，创设卫气营血辨证要领之后，在中医理论和辨证要领上的又一创举。“三焦辨证”法：便是将人体“横向”地分为上、中、下三焦。上焦以心肺为主，中焦以脾胃为主，下焦包孕肝、肾、年夜小肠及膀胱。由此创设了一种新的人体脏腑归类要领，此法非凡很是合用于温热病系统的辨证和治疗，诊断明晰，便于施治。而且设立建设了三焦的正常传变方法是由上而下的“顺传”路子，“温病由口鼻而入，鼻气通于肺，口气通于胃，肺病逆传则为心包，上焦病不治，则传中焦，胃与脾也；中焦病不治，则传下焦。始上焦，终下焦。”因而，由传变方法也就抉择了治疗原则：“治上焦如羽，非轻不举；治中焦如衡，非降不安；治下焦如沤，非重不沉。”同时，吴氏对《伤寒论》的六经辨证，同样采纳了积极采用的立场，以为“伤寒六经过表入里，由浅入深，须横看；本节论三焦，由上及下，亦由浅入深，须竖看。”这些理论，虽然从立论方法和剖析要领上有所差别，但实际上照旧对叶天士的卫气营血辨证法的担任，并对其举办了很年夜的成长，尤其是在对疾病厘革的了解上，是可以权衡和谐的，二者并无抵牾之处。同时，三焦辨证法也完美了叶天士卫气营血说的治疗法例。叶氏的《温热论》中没有收载充足的丹方，而吴鞠通的另一重年夜孝敬，便是在《温病条辨》傍边，为后人留下了良多优越的适用丹方，象银翘散、桑菊饮、藿喷香正气散、清营汤、清宫汤、犀角地黄汤等等，都是后裔医家极为常用的丹方。此刻临床上使用的方子，《温病条辨》方占十之八九。
吴塘对中医学的孝敬，在于对中医立法上的刷新和理论上的完美，尤其对付温热性疾病的治疗，他对付理论的阐扬和留下的诸多丹方，可以说使得中医的根基治法在外感病和热性病方面获得了进一步的完美。在告别中医“四年夜经典”的时辰，有一种划法，便是将吴氏的《温病条辨》与汉代的《黄帝内经》、《伤寒论》和《神农本草经》并列为中医比读的“四年夜经典”。可见该书在中医理论阐扬上的重年夜意义。吴鞠通，是中国医学史上不成多得的具有培植性的代表人物之一。
